周祖翼在十次党代会报告中提出了中长期的目标愿景与发展战略，我们的目标愿景是：把同济大学建设成为以可持续发展为导向的世界一流大学。
      周祖翼说，世纪风雨，百年沧桑。从1907年德文医学堂创建，到1912年工科设立，自1927年晋升国立大学行列，至上世纪40年代建成含理工文法医五大学院的综合性大学，同济已经蜚声海内外；新中国成立后，历经50年代院系调整、改革开放初期的“两个转变”，于90年代中期提出建设综合性、研究型、国际化高水平大学，至今综合性、研究型、国际化的格局基本形成。从初建时的筚路蓝缕、艰难起步，到战火年代的辗转迁徙，同济不畏时艰，积极办学，和民族同呼吸，与祖国共命运；从50年代的浴火重生，到改革开放后的开拓奋进，同济志存高远，兼收并蓄，与人类文明的进步休戚相依。同济办学的历史，是与中华民族休戚与共、与祖国科教事业心手相连、与上海城市发展相濡以沫的光辉历史。
      今天，同济大学已站在了新的历史起点上。人类进入21世纪，科学技术突飞猛进，物质文明高度发达，但人口膨胀、资源短缺、环境恶化和生态失衡等问题迫在眉睫，强烈呼唤生产消费模式的整体变革，可持续发展已经成为人类面向未来的必然选择。大学是孕育思想、传播理念、培养人才、创新科技的主体和引领社会进步的重要力量。在人类知识结构和教育体系上进行根本变革，使之适应可持续发展的新理念，是一流大学责无旁贷的历史责任。
      周祖翼说，展望前程，全面建成小康社会指日可待，富强民主文明和谐的社会主义现代化国家前途光明，实现美丽的“中国梦”必然需要一批优秀中国大学努力跻身世界一流大学行列。
      面对新的历史起点，我们要以宽广的视野和敏锐的战略思维，将同济的发展置于学校历史传统、全球发展趋势、民族伟大复兴的大背景下，以百年同济的积淀和精神团结凝聚广大同济人迎接挑战，勇立潮头。学校的目标愿景是：把同济大学建设成为以可持续发展为导向的世界一流大学。
      周祖翼说，建设以可持续发展为导向的世界一流大学，就是要以优势学科为龙头，注重多学科交叉与集成创新，形成可持续发展学科体系，努力将可持续发展理念和实践渗透到人才培养、科学研究、社会服务、文化传承创新以及校园建设与管理等各个领域，建立面向可持续发展的高等教育新模式，在理念与实践、技术与方法、知识与理论、文化与文明等方面推动人类社会进步。
      建设以可持续发展为导向的世界一流大学是一个长期、艰苦的奋斗过程，需要凝心聚力、坚持不懈。我们坚信，同济大学坚持以可持续发展为导向，经过两个阶段的努力，到本世纪中叶一定可以跻身世界一流大学的行列！
      第一阶段到2020年前后，在我国全面建成小康社会和创新型国家之际，学校基本形成以可持续发展为导向的办学特色，国际知名度显著提升，现代大学制度及文化逐步完善，3-5个学科达到国际一流水平，15-20个学科达到国际先进、国内一流水平，学科整体实力得到提升，在培养拔尖创新人才、造就学术领军人物和积聚创新团队、开展高水平科学研究、服务国家与社会重大战略需求等方面取得显著成效，全面建成综合性、研究型、国际化的世界知名高水平大学，为建设以可持续发展为导向的世界一流大学奠定坚实的基础。
      第二阶段到2050年前后，在我国建成社会主义现代化国家之际，学校以可持续发展为导向的办学特色更加凸显，在世界学术领域的地位显著提升，形成若干世界拔尖水平学科，专业精英与社会栋梁的人才培养声誉卓著，对中国与世界的可持续发展贡献突出，为人类知识、文明的创造与传承发挥更加重要的作用，主要办学指标和整体实力总体上达到世界一流大学水平。
      周祖翼在报告中指出，要实现上述宏伟目标，我们必须奋发有为，在全面推进学校内涵式发展上作出更大的努力。
      ——坚持把提升办学质量作为学校发展的根本任务。要加快实现从以量的扩张为特征的外延式发展，向以提升质量为核心的内涵式发展转变，要自觉将提高质量融汇于人才培养、科学研究、社会服务、文化传承创新的各项工作之中，尤其要牢固树立人才培养的中心地位，坚持和完善知识、能力、人格全面发展的教育理念，坚持和强化引领可持续发展的专业精英和社会栋梁的人才培养目标，创新人才培养模式和质量保证体系，大力提升人才培养质量。
      ——坚持把人才队伍建设作为学校发展的关键所在。要坚持党管人才原则，在人事与人才制度改革方面实现突破，以建设高水平教师队伍、专职科研队伍和高水平管理队伍为重点，明显优化师资队伍结构，显著提升师资队伍水平。
      ——坚持把改革创新作为推进学校跨越发展的强大动力。要永不懈怠，努力探索，深化对建设世界一流大学办学规律的认识，完善适应教育全球化的办学体制机制，深化综合改革，系统推进学科、教学、科研、人才队伍、国际化等领域的改革向纵深发展。
      ——坚持把制度完善作为学校各项事业科学发展的基本保障。要立足基本校情，遵循教育规律，解放思想，大胆突破，推进制度创新，努力形成有利于学校科学发展的体制机制。要理顺学校决策系统、执行系统、咨询系统、监督系统之间的关系，改革学校管理方式，以系统完善的现代大学制度，实现学校从经验管理向科学管理的转变，提高学校管理的科学化、规范化水平。