2007年6月7日上午11点，由法国政府、上海科学技术委员会、同济大学环境科学与工程学院共同设立的中法崇明生态岛合作实验室揭幕。
据悉，由于长三角地带水环境越来越恶劣，中法崇明岛合作实验室将在崇明的岛上做试点，通过一系列的实验和研究，试图解决目前水质恶化、环境变得越来越糟糕的局面。其中，法方将投资100万欧元。
上海市科学技术委员会联合同济大学、复旦大学、东化大学、上海大学、上海水产大学等高校成立崇明生态联合实验室，以期解决上海和长三角地区面临的诸多环境问题。
在此先已经成立的一个实验室是，上海科委领导下的崇明水环境研究实验室。
为了解决崇明生态岛建设过程中的水资源保护和水污染防治等科学问题，根据上海时科委的部署，崇明水环境实验室已同济大学，东华大学，上海大学和上海水产大学为技术依托，于2005年6月20日成立，总体定位是崇明三岛的水环境建设和社会注意新农村摄取环境建设提供科技支撑。
通过实现崇明水环境研究与长江下游河口地区科研总体规划构想的有机结合，为保护长江提供科技支撑。核心研究包括：河流，水库/湖泊的水质演化规律与污染控制技术；崇明岛苦咸水的水质改善与饮用水完全保障技术。
