近日,2024年合成生物学领域国际顶尖赛事﹣国际基因工程机器大赛(International Genetically Engineered Machine Competition,iGEM)在法国巴黎落幕,来自全球多个国家和地区的438支注册队伍同台竞技。同济大学生命科学与技术学院2支代表队伍(Tongji-China、Tongji-Software)经过激烈角逐,最终以优异成绩脱颖而出,双双斩获金奖。
国际基因工程机器大赛(iGEM)是由麻省理工举办的合成生物学领域的国际学术竞赛。比赛要求学生自主选题,并运用合成生物学等知识解决当地的某些问题。iGEM分为高中生组、本科生组和研究生组3大组别。参赛者可以在环境、医疗、食品、基础研究、太空、时尚等多个赛道中自由选择其一参与。整个竞赛周期长达1年,为学生们提供了一个深入研究的宝贵机会,让他们得以探索生物学的奥秘。在竞赛的最后阶段,各团队通过答辩展示,详细介绍各自的工作成果与收获。
Tongji-China代表队:Nailiva: Revolutionizing Nails with Microbial Elegance
在深入探究现有指甲油产品可能引发的健康风险及对环境造成的影响后,Tongji-China的同学们创造性地开发出一款独特的合成生物学美甲产品。他们受到贻贝能够牢固粘附于礁石机制的启发,成功表达了一种贻贝杂交蛋白,并将这种蛋白与水凝胶巧妙结合,制造出一种既环保又具有强大粘合力的材料。他们还通过精确操控工程大肠杆菌产生酶来诱导红色、黄色和蓝色色素的生成,实现了不同图案的动态展现,为用户提供了丰富多样的个性化美甲艺术选择。为了生产更精细的美甲产品,同学们建立了基于流体力学的扩散模型和基于反射率曲线的颜色混合模型,预测并可视化美甲的颜色与图案变化,并建立了TCRA框架来贯彻人类实践活动,不断与社会各界积极交流,获得改进与提升。
成员名单:
队长:(按姓氏拼音排序)
生命科学与技术学院:常歆迪、宁书芮、吴弈桐、袁金铃
团队成员:(按姓氏拼音排序)
生命科学与技术学院:白镇华、曹欣源、陈潇雯、韩汭宸、詹怀喆、张馨月、邹文铎
建筑与城市规划学院:姚紫雯
设计创意学院:华夏、肖静雯
计算机科学与技术学院:孙静怡、朱昱瑾
医学院:方可
口腔医学院:贾双萌
Tongji-Software代表队:Atlas.Y: Advanced Targeting Localization Assistance System for Yeast
Atlas.Y是一种专为优化酵母中蛋白质亚细胞定位而设计的专业工具。它利用信号肽和连接子数据库来构建具有精确定位信号的融合蛋白。该软件采用ESM-fold模型进行快速3D结构预测,使用Rosetta模型评估蛋白质稳定性,并借助CAD评分确保功能一致性。DeepLoc 2.0则用于验证定位的准确性。此外,Atlas.Y还采用基于图神经网络的深度学习算法进行定向进化,使蛋白质能够适应特定的微环境。对于需要精确控制的应用,该系统提供了一个动态版本,集成了光遗传学技术,以实现蛋白质定位的时空调控。
成员名单
队长:(按姓氏拼音排序)
计算机科学与技术学院:林继申
生命科学与技术学院:宁书芮、袁金铃
团队成员:(按姓氏拼音排序)
生命科学与技术学院:白镇华、廖惜陈、徐颖
建筑与城市规划学院:姚紫雯
计算机科学与技术学院:樊佳欣、刘淑仪、张文健、赵卓冰
设计创意学院:党馨雨、万怡然、汪志烨
经济管理学院:崔希
数学科学学院:王衡宇
备赛期间,同济大学2支参赛队伍积极行动,进行了往期项目的深入调研、精心选题、软件功能设计、实验方案设计、人文实践活动,以及算法与建模设计。为了更全面地掌握理论研究的精髓和实际生产的最新前沿,他们专程参观访问了相关企业、医院及社区,成功获取了宝贵的第一手资料。此外,他们还与其他高校参赛队伍展开了广泛交流与合作。生命科学与技术学院成立了由多位老师组成的竞赛指导组,在项目进行期间定期进行精心指导,保证了项目的质量。